Как перекрывать div

Возможно поможет, выведено с помощью z-index, остальные поля вы можете настроить.

.section5{
  width:100%;
  background-color:#f5f5f5;
  height:550px;
  position: relative;
  z-index:0;
}
.square1{
  width:255px;
  height:193px;
  background-color:#969696; 
  position: relative;
  z-index:1;
}
.base{
    background:#e2e2e2;
    width:1020px;
    height:350px;
    position: absolute;
    top: 100px;
    left:130px;
  z-index: -1;
}

<div class = "section5">
    <div class = "base"></div>
    <div class = "square1"></div>
</div>

Начнем с основы нашего HTML:

<div class = "section5">
    <div class = "base"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
</div>

И стиль:

.section5 {
    position: relative;
    width: 800px;
    height: 600px;
    background-color: #f5f5f5
}

.base {
    position: relative;
    width: 600px;
    height: 400px;
    background-color: #e2e2e2;
    left: 100px;
    top: 100px;
}

.square {
    position: absolute;
    width: 150px;
    height: 120px;
    background-color: #969696;
}

Теперь мы можем использовать nth-of-type, чтобы сделать квадраты odd белыми:

.square:nth-child(odd) {
    background-color: white;
}

Чтобы вычислить абсолютное положение квадратов, если мы хотим, чтобы первый и последний квадрат имели зазор 50px от квадрата .section5, и у нас есть квадраты n, мы можем вычислить расстояние d между двумя соседними квадратами следующим образом:

d = (W - 2x - w) / (n - 1)

где W — ширина .section5, а x — зазор 50px, о котором мы упоминали ранее. Таким образом, d в данном случае будет 110px, поэтому left каждого квадрата нужно увеличить на 110px по сравнению с предыдущим.

Та же логика применима и к top.

И применив их, получаем конечный результат (открываем как на ладони)

.section5 {
    position: relative;
    width: 800px;
    height: 600px;
    background-color: #f5f5f5;
}

.base {
    position: relative;
    width: 600px;
    height: 400px;
    background-color: #e2e2e2;
    left: 100px;
    top: 100px;
}

.square {
    position: absolute;
    width: 150px;
    height: 120px;
    background-color: #969696;
}

/* Apply alternating background color to odd squares */
.square:nth-child(odd) {
    background-color: white;
}

/* Positioning the squares */
.square:nth-child(2) {
    left: 50px;
    top: 50px;
}

.square:nth-child(3) {
    left: 160px;
    top: 126px;
}

.square:nth-child(4) {
    left: 270px;
    top: 202px;
}

.square:nth-child(5) {
    left: 380px;
    top: 276px;
}

.square:nth-child(6) {
    left: 490px;
    top: 354px;
}

.square:nth-child(7) {
    left: 600px;
    top: 430px;
}

<div class = "section5">
    <div class = "base"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
    <div class = "square"></div>
</div>

Альтернативный подход с использованием переменных CSS:

.square {
    position: absolute;
    width: 150px;
    height: 120px;
    background-color: #969696;
    left: calc(50px + 110px * var(--i));
    top: calc(50px + 76px * var(--i));
}

.square:nth-child(2) { --i: 0; }
.square:nth-child(3) { --i: 1; }
.square:nth-child(4) { --i: 2; }
.square:nth-child(5) { --i: 3; }
.square:nth-child(6) { --i: 4; }
.square:nth-child(7) { --i: 5; }